47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0734 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  81.77 
 
 		 192 aa  320  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  81.25 
 
 		 192 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  80.73 
 
 		 192 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  80.73 
 
 		 192 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  75.39 
 
 		 187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  70.83 
 
 		 144 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  56.06 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  65.06 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  40.72 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  34.02 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  31.98 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  32.28 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.94 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  31.71 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  34.97 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  30.72 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.24 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  28.93 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.63 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  27.92 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  29.78 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  26.92 
 
 		 355 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  29.35 
 
 		 372 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  29.35 
 
 		 372 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.35 
 
 		 373 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  28.5 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  31.06 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  28.5 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  28.28 
 
 		 387 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  28.64 
 
 		 370 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.37 
 
 		 366 aa  48.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  26.44 
 
 		 354 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 368 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.35 
 
 		 369 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 367 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0119  hypothetical protein  28 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1138  OmpA-like transmembrane domain protein  28.25 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000563835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  30.07 
 
 		 367 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  29.21 
 
 		 369 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  27.97 
 
 		 356 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  29.21 
 
 		 369 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  25 
 
 		 367 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  27.21 
 
 		 373 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3022  putative outer membrane protein  29.63 
 
 		 170 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>