36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0119 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0119  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 		 376 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  30.24 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  28.96 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  32.2 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  24.75 
 
 		 367 aa  51.2  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.5 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.17 
 
 		 318 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  32.5 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  27.73 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  26.32 
 
 		 369 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  24.16 
 
 		 351 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.72 
 
 		 320 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  24.41 
 
 		 358 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2709  OmpA-like transmembrane region  34.62 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103983  normal  0.0521155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  23.13 
 
 		 369 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  23.2 
 
 		 346 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  23.2 
 
 		 346 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  24 
 
 		 354 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  23.29 
 
 		 371 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  23.2 
 
 		 346 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  23.2 
 
 		 365 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  23.2 
 
 		 346 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  23.57 
 
 		 350 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  23.2 
 
 		 346 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  28.07 
 
 		 191 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  29.51 
 
 		 372 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  24.84 
 
 		 361 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  29.51 
 
 		 372 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.51 
 
 		 373 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  22.6 
 
 		 358 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  22.45 
 
 		 358 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  22.82 
 
 		 369 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  29.66 
 
 		 355 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>