43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2709 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2709  OmpA-like transmembrane region  100 
 
 		 200 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103983  normal  0.0521155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  65 
 
 		 196 aa  257  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  45.77 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  31.52 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  30.98 
 
 		 376 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  27.17 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  30.68 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  30.68 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.5 
 
 		 373 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  28.71 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  30 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  33.73 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  27.23 
 
 		 404 aa  51.6  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  26.73 
 
 		 357 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  26.73 
 
 		 353 aa  51.2  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  26.73 
 
 		 353 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 		 369 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 		 363 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 366 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2129  OmpA family protein  29.44 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3022  putative outer membrane protein  31.75 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  27.92 
 
 		 358 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  31.25 
 
 		 370 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  35.94 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  25.57 
 
 		 371 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  28.36 
 
 		 356 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2367  OmpA domain-containing protein  27.62 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0117742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 		 369 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  31.34 
 
 		 354 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  30.65 
 
 		 355 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  27.21 
 
 		 326 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  32.46 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  22.99 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 		 367 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  23.22 
 
 		 358 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  32.46 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  22.99 
 
 		 358 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  32 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0119  hypothetical protein  34.62 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  22.41 
 
 		 358 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  22.41 
 
 		 369 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  29.7 
 
 		 361 aa  41.6  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  30.1 
 
 		 377 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>