28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1858 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  52.86 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.05 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  30.48 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  30.48 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  27.64 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  28.99 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  29.5 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  25.74 
 
 		 369 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  34.69 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  30.53 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0119  hypothetical protein  30.94 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  33.61 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  30.41 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  30.22 
 
 		 144 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  29.73 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  25.94 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  26.91 
 
 		 404 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  32.67 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  28.22 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  30.77 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  25.43 
 
 		 356 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 		 372 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 		 372 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  24.42 
 
 		 196 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  26.28 
 
 		 346 aa  41.6  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  28.57 
 
 		 369 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  35.44 
 
 		 341 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>