60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3870 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  57.81 
 
 		 192 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  57.29 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  56.77 
 
 		 192 aa  227  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  57.73 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  61.66 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  59.79 
 
 		 187 aa  214  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  57.67 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  54.86 
 
 		 144 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  38.34 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  33.51 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  29.35 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  34.3 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  30.1 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.32 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  29.69 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.92 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  30.57 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  26.96 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  31 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  31 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.15 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  31.03 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  26.15 
 
 		 373 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 		 372 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 		 372 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  27.18 
 
 		 377 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  26.53 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  25.25 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0119  hypothetical protein  29.55 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  25.32 
 
 		 346 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 		 363 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 		 369 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  27.72 
 
 		 367 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 		 373 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  26.9 
 
 		 387 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  34.35 
 
 		 331 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1138  OmpA-like transmembrane domain protein  25.75 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000563835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 		 367 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  27.5 
 
 		 366 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 		 369 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1008  hypothetical protein  26.32 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 		 369 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  25.52 
 
 		 376 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  30.63 
 
 		 370 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  25.49 
 
 		 354 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  26.32 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  28.07 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1774  outer membrane protein  27.43 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000106277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  27.41 
 
 		 367 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  25.62 
 
 		 355 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0413  outer membrane protein  27 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.43921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1376  putative outer membrane protein  29.24 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2718  outer membrane protein  29.24 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.700569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  30.43 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  24.86 
 
 		 373 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  31.41 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  26.56 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  25.99 
 
 		 368 aa  41.2  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>