23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3791 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  89.58 
 
 		 192 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  89.58 
 
 		 192 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  98.43 
 
 		 192 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  74.31 
 
 		 192 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  77.17 
 
 		 191 aa  181  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  69.29 
 
 		 187 aa  157  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  55.04 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  60.68 
 
 		 189 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  45.97 
 
 		 193 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  33.64 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  24.79 
 
 		 192 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.22 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  33.33 
 
 		 320 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  31.9 
 
 		 318 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  36.49 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  31.3 
 
 		 321 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  35.44 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  29.17 
 
 		 341 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2666  hypothetical protein  57.14 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 373 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  23.9 
 
 		 404 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  37.88 
 
 		 355 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>