74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004315 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  74.48 
 
 		 192 aa  291  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  71.88 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  71.35 
 
 		 192 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  71.35 
 
 		 192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  75.39 
 
 		 191 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  65.62 
 
 		 189 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  53.54 
 
 		 198 aa  191  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  69.29 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  41.45 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  32.34 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  31.25 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  31.03 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  31.03 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  30.54 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  31.03 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  31.71 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  31.03 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  31.53 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  29.65 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  29.65 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  29.65 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  29.65 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.65 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  29.65 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  29.65 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  29.69 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  33.58 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  28.71 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  28.27 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.34 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  30.35 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  30.35 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  28.08 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  29.5 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  31.43 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  29.01 
 
 		 320 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  30.13 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 		 369 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 		 363 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  29.41 
 
 		 370 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 369 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  30.11 
 
 		 321 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  30.06 
 
 		 318 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 369 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.12 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 368 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  30.06 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 		 367 aa  51.2  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  37.29 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  27.49 
 
 		 358 aa  51.2  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  25.69 
 
 		 361 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  28.71 
 
 		 373 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.63 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  23.5 
 
 		 367 aa  48.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  27.98 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  26.83 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  26.83 
 
 		 357 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  26.83 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 		 367 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  25.87 
 
 		 377 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 376 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  26.9 
 
 		 387 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  26.62 
 
 		 171 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  31.93 
 
 		 179 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  27.13 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  26.09 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 		 365 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  24.88 
 
 		 366 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  26.09 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 331 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  25.26 
 
 		 373 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  26.15 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  28.83 
 
 		 188 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>