32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4651 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  100 
 
 		 175 aa  342  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  30.29 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  31.71 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  31.36 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  28.81 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  26.47 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  32.68 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  28.66 
 
 		 198 aa  51.2  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  29.59 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 372 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 372 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 373 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  35.59 
 
 		 370 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.45 
 
 		 366 aa  48.5  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  27.53 
 
 		 369 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  27.53 
 
 		 369 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  30.16 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  30.16 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  30.54 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  25.7 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  25.7 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.59 
 
 		 369 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  25.61 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  25.7 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  30.16 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  28.4 
 
 		 363 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02499  hypothetical protein  28.76 
 
 		 171 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  25.42 
 
 		 365 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  29.07 
 
 		 341 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3022  putative outer membrane protein  31.53 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  28.57 
 
 		 368 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>