41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2541 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2709  OmpA-like transmembrane region  68.5 
 
 		 200 aa  258  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103983  normal  0.0521155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  51.53 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  29.25 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  27.96 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  28.8 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  30.3 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  26.97 
 
 		 371 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  23.92 
 
 		 358 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  25 
 
 		 369 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  25 
 
 		 369 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  25 
 
 		 358 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  25 
 
 		 358 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  24.71 
 
 		 350 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3022  putative outer membrane protein  30.84 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  25.37 
 
 		 355 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  25.86 
 
 		 404 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 372 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2367  OmpA domain-containing protein  28.16 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0117742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 372 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  29.71 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  26.56 
 
 		 373 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  27.21 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02499  hypothetical protein  27.59 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  22.6 
 
 		 365 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  22.6 
 
 		 354 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.47 
 
 		 373 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  24.81 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  24.81 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  24.81 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  24.81 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  25 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  28.46 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  24.81 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  28.26 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  24.42 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  26.43 
 
 		 361 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  27.65 
 
 		 354 aa  42  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 367 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  28.4 
 
 		 342 aa  41.2  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>