15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02499 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02499  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  339  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  84.21 
 
 		 171 aa  298  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0998  hypothetical protein  49.12 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003547  hypothetical protein  48.24 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1699  outer membrane protein, OmpA-like  45.61 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02500  hypothetical protein  46.67 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  27.16 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  30.23 
 
 		 355 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  28.28 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2367  OmpA domain-containing protein  29.2 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0117742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  33.9 
 
 		 175 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  27.54 
 
 		 185 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  27.54 
 
 		 185 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  27.43 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  28.66 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>