65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0553 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  98.96 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  99.48 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  82.81 
 
 		 192 aa  323  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  80.73 
 
 		 191 aa  296  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  71.35 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  98.43 
 
 		 144 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  53.54 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  56.77 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  40 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  27.66 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  32.28 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  29.63 
 
 		 320 aa  57.8  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  28.8 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.05 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  26.37 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.73 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  29.1 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  32.35 
 
 		 355 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  31.85 
 
 		 354 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  29.1 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  27.18 
 
 		 346 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  27.18 
 
 		 365 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27.18 
 
 		 346 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  27.18 
 
 		 346 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  27.18 
 
 		 346 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  27.18 
 
 		 346 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  37.07 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  27.18 
 
 		 354 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  27.62 
 
 		 346 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  25.82 
 
 		 367 aa  51.2  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  28.21 
 
 		 321 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  30.49 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  31.11 
 
 		 367 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  31.48 
 
 		 368 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 373 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  27.53 
 
 		 372 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  27.53 
 
 		 372 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  27.75 
 
 		 366 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  26.73 
 
 		 324 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  25.81 
 
 		 355 aa  47.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  30.82 
 
 		 361 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  32.41 
 
 		 358 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  28.5 
 
 		 370 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  26.15 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  28.17 
 
 		 353 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  28.17 
 
 		 353 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  27.85 
 
 		 357 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  26.7 
 
 		 376 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  26.97 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  28.08 
 
 		 373 aa  45.1  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  27.59 
 
 		 387 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  28.3 
 
 		 373 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 369 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  24.02 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  29.36 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  25.77 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  28.17 
 
 		 356 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  30.49 
 
 		 367 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 		 365 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  28.98 
 
 		 369 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  28.98 
 
 		 369 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1138  OmpA-like transmembrane domain protein  25.57 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000563835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  27.18 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  30.41 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>