90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2666 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2666  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  88.14 
 
 		 924 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  88.14 
 
 		 924 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  88.14 
 
 		 924 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  84.75 
 
 		 883 aa  100  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  84.75 
 
 		 883 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  84.75 
 
 		 883 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  85 
 
 		 884 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  83.05 
 
 		 872 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  71.67 
 
 		 899 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  77.97 
 
 		 966 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  71.19 
 
 		 895 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  70 
 
 		 935 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  70 
 
 		 935 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  70 
 
 		 935 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  63.93 
 
 		 930 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  63.93 
 
 		 930 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  65.57 
 
 		 876 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  63.93 
 
 		 930 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  66.67 
 
 		 938 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  63.93 
 
 		 869 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  65 
 
 		 907 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  62.5 
 
 		 936 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  63.93 
 
 		 937 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  71.19 
 
 		 896 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  73.58 
 
 		 966 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  60 
 
 		 948 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  67.8 
 
 		 907 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  72.88 
 
 		 893 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  59.02 
 
 		 966 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  66.1 
 
 		 965 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  54.24 
 
 		 709 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  54.24 
 
 		 853 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  54.24 
 
 		 853 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  54.24 
 
 		 853 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  70 
 
 		 868 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  69.49 
 
 		 933 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  59.02 
 
 		 873 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  55.56 
 
 		 890 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  55.56 
 
 		 890 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  56.67 
 
 		 869 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  61.11 
 
 		 849 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  52.38 
 
 		 890 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  47.37 
 
 		 841 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  54.1 
 
 		 891 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  55.74 
 
 		 873 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  54.69 
 
 		 886 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  49.15 
 
 		 853 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  57.69 
 
 		 882 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  57.69 
 
 		 882 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  54.69 
 
 		 886 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  57.69 
 
 		 892 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  49.15 
 
 		 855 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  53.97 
 
 		 957 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  63.49 
 
 		 912 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  49.15 
 
 		 838 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  63.64 
 
 		 861 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  51.61 
 
 		 935 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  63.64 
 
 		 861 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  57.14 
 
 		 842 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  46.67 
 
 		 843 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  61.36 
 
 		 861 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  46.03 
 
 		 929 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  67.44 
 
 		 857 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  64.29 
 
 		 861 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  64.29 
 
 		 852 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  64.29 
 
 		 861 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  64.29 
 
 		 861 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  50.77 
 
 		 836 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  54.72 
 
 		 922 aa  50.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  81.82 
 
 		 855 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  54.69 
 
 		 894 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  53.33 
 
 		 909 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  62.22 
 
 		 875 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  50.85 
 
 		 853 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  55.56 
 
 		 871 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  72.22 
 
 		 847 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 896 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  51.67 
 
 		 967 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  50.85 
 
 		 909 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  50 
 
 		 839 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  55.26 
 
 		 910 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  44.83 
 
 		 834 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 944 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  50.82 
 
 		 944 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  82.61 
 
 		 855 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  57.14 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  52.27 
 
 		 925 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  45.21 
 
 		 966 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  40.38 
 
 		 866 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>