21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3008 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  335  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1303  hypothetical protein  44.32 
 
 		 185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.13528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.21 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  29.05 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  33.54 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4199  hypothetical protein  27.87 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  32.72 
 
 		 211 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  29.63 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1500  putative outer-membrane protein  31.13 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2794  opacity protein and related surface antigens-like protein  33.33 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  31.9 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  35.14 
 
 		 215 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2620  OmpA domain-containing protein  30.19 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  29.28 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  31.01 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  29.28 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  35.21 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  28.65 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  32.93 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0088  hypothetical protein  26.44 
 
 		 173 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100893  normal  0.732362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.24 
 
 		 187 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>