12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2368 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2368  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.175776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2367  OmpA domain-containing protein  82.56 
 
 		 193 aa  322  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0117742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2369  OmpA domain-containing protein  70.1 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2366  hypothetical protein  64.8 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.613127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  51.81 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2129  OmpA family protein  52.85 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  27.49 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  28.46 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  28.57 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  28.57 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  29.06 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  28.8 
 
 		 188 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>