10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0998 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0998  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003547  hypothetical protein  70 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02500  hypothetical protein  71.25 
 
 		 160 aa  194  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1699  outer membrane protein, OmpA-like  53.12 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  50.88 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02499  hypothetical protein  49.12 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  30.46 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  28.07 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  36.99 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>