24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1699 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1699  outer membrane protein, OmpA-like  100 
 
 		 177 aa  362  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0998  hypothetical protein  53.12 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003547  hypothetical protein  53.46 
 
 		 159 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  50.29 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02500  hypothetical protein  53.46 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02499  hypothetical protein  45.61 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  29.68 
 
 		 354 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  28.66 
 
 		 365 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  29.83 
 
 		 341 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  28.25 
 
 		 369 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  28.25 
 
 		 369 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  28.25 
 
 		 358 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  28.25 
 
 		 358 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  27.93 
 
 		 371 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  29.22 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  29.22 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  29.22 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  29.22 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.22 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  28.87 
 
 		 346 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  28.93 
 
 		 358 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  27.84 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  30.13 
 
 		 355 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  28.75 
 
 		 354 aa  42.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>