More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  51.85 
 
 		 284 aa  231  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  56.02 
 
 		 221 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  52.56 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  49.54 
 
 		 295 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  51.61 
 
 		 284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  49.54 
 
 		 295 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  49.54 
 
 		 295 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  49.54 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  49.54 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  49.54 
 
 		 295 aa  222  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  49.54 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  49.54 
 
 		 297 aa  222  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  52.47 
 
 		 327 aa  222  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  49.07 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  49.78 
 
 		 291 aa  221  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  49.07 
 
 		 297 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  50.47 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  50.47 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  50.47 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  50.47 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  49.54 
 
 		 287 aa  218  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  51.69 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  50 
 
 		 285 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  49.32 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  49.32 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  49.32 
 
 		 285 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  49.32 
 
 		 285 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  49.32 
 
 		 285 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  50.24 
 
 		 291 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  49.32 
 
 		 285 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  49.32 
 
 		 285 aa  214  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  48.86 
 
 		 285 aa  214  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  54.21 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  49.29 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  48.15 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  49.29 
 
 		 290 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  49.52 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  51.4 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  47.95 
 
 		 285 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  50.7 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  47.87 
 
 		 294 aa  207  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  51.14 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  50.49 
 
 		 299 aa  205  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  53.62 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  53.27 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  54.41 
 
 		 270 aa  204  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  47.22 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  51.44 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.36 
 
 		 319 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  54.59 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  49.54 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.6 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.6 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.83 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  47.83 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  46.48 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  46.77 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  48.76 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  43.59 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  43.33 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  41.58 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25.65 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  33.02 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 187 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.95 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  29.79 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.89 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  29.79 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.73 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  29.79 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.36 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>