77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1045 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 476 aa  930    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  63.03 
 
 		 459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  65.96 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  61.26 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.93 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  55.67 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  53.24 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  55.07 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.93 
 
 		 464 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  50.93 
 
 		 464 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  61.41 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  53.96 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  52.07 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  52.25 
 
 		 468 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.06 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  54.1 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  50.62 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  51.43 
 
 		 465 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.7 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  50.62 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  51.36 
 
 		 454 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  46.89 
 
 		 505 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  52.81 
 
 		 557 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  53.29 
 
 		 462 aa  354  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  50.52 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  49.31 
 
 		 493 aa  349  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  48.55 
 
 		 460 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  48.14 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.54 
 
 		 478 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  48.25 
 
 		 452 aa  333  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  53.18 
 
 		 446 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  49.89 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  51.56 
 
 		 457 aa  326  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  48.55 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  48.25 
 
 		 432 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  47.85 
 
 		 489 aa  322  7e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  51.2 
 
 		 441 aa  320  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  47.87 
 
 		 464 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  48.55 
 
 		 496 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  49.17 
 
 		 457 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  53.49 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  49.5 
 
 		 477 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  45.02 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  49.02 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  47.61 
 
 		 473 aa  276  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  46.5 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  36.6 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  38.59 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  36.74 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  34.28 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  37.12 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  36.89 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  34.07 
 
 		 523 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.06 
 
 		 532 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.62 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.22 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  36.36 
 
 		 673 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  36.95 
 
 		 840 aa  90.5  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  34.73 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.29 
 
 		 2160 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.85 
 
 		 884 aa  57.4  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  25.9 
 
 		 759 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  35.22 
 
 		 717 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  41 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.48 
 
 		 601 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.5 
 
 		 530 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.81 
 
 		 1037 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1106 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  44.3 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  26.73 
 
 		 523 aa  47  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  27.2 
 
 		 913 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.61 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.38 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  29.59 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  32.88 
 
 		 593 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1003 aa  43.9  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>