163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0089 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2065  iron dependent repressor  52.71 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0581  iron dependent repressor  36.22 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000800719  hitchhiker  0.0013291 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  31.82 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  31.2 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1752  iron dependent repressor  28.45 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.85 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.01 
 
 		 212 aa  67  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  31.67 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.6 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  32.11 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.96 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  31.3 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.4 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.28 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  31.54 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.08 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  23.97 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0817  iron dependent repressor  26.89 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.159865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  28.46 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  29.6 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.89 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  36.47 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.97 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  30.89 
 
 		 255 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  29.36 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  29.36 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  28.46 
 
 		 232 aa  57  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 		 216 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.25 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.27 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  25.2 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  25.2 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  29.36 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.16 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0992  iron dependent repressor  26.45 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0545444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.84 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  28.46 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.08 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.81 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  30.08 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  26.02 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  28.72 
 
 		 441 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  28.46 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.36 
 
 		 227 aa  53.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  27.66 
 
 		 441 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  26.96 
 
 		 218 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2089  iron dependent repressor  25.47 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  27.19 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.27 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.19 
 
 		 237 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  28.46 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.68 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.23 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.68 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  30.69 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  30.19 
 
 		 237 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  26.92 
 
 		 248 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  26.92 
 
 		 242 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  25.45 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  26.17 
 
 		 251 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  28.3 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  28.23 
 
 		 229 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.93 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  26.83 
 
 		 227 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  26.12 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.88 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.32 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  26.92 
 
 		 228 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.2 
 
 		 227 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.88 
 
 		 229 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  50.4  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  23.31 
 
 		 240 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.83 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1170  iron dependent repressor  23.47 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.41 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.46 
 
 		 241 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.07 
 
 		 236 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  27.69 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  30.77 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 230 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.62 
 
 		 238 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.07 
 
 		 229 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.07 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.07 
 
 		 234 aa  47.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.19 
 
 		 225 aa  47.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  27.91 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  25.81 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  25.56 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  25.81 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  25.81 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  27.82 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  27.64 
 
 		 234 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.89 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  26.23 
 
 		 220 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>