More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0452 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 352 aa  713    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  80.97 
 
 		 351 aa  578  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  78.41 
 
 		 351 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  78.41 
 
 		 351 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  78.12 
 
 		 352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  78.12 
 
 		 352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  78.41 
 
 		 352 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  78.41 
 
 		 352 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  77.56 
 
 		 351 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  74.21 
 
 		 358 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  67.71 
 
 		 364 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  75.58 
 
 		 301 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  64.38 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  44.65 
 
 		 380 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  44.12 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  44.83 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  45.4 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  45.43 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  42.6 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  42.3 
 
 		 366 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  40.47 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 393 aa  245  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  39.16 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  39.16 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  43.31 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.56 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  42.38 
 
 		 371 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  40.59 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 397 aa  238  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  41.99 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  38.9 
 
 		 393 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  40.06 
 
 		 344 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  41.3 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.06 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  41.89 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  41.36 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  43.2 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41 
 
 		 372 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  41.59 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  39.43 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  38.94 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  41.82 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.86 
 
 		 411 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  42.22 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 413 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  41.02 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 374 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  41.9 
 
 		 374 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 374 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  42.59 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  41.64 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  38.28 
 
 		 413 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  40.84 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  39.07 
 
 		 402 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  39.12 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  38.74 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  39.34 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  42.11 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  39.04 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  37.74 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  37.82 
 
 		 354 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  38.19 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  36.25 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.49 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  38.85 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.83 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.25 
 
 		 374 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  36.79 
 
 		 414 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  36 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  39.88 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 347 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  36.77 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  39.06 
 
 		 378 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  34.99 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>