103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0890 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  100 
 
 		 524 aa  1092    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  49.71 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  46.89 
 
 		 531 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  31.93 
 
 		 663 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  30.86 
 
 		 652 aa  233  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  29.82 
 
 		 669 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  29.79 
 
 		 634 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  28.43 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  27.55 
 
 		 673 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 573 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  29.01 
 
 		 677 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.5 
 
 		 1764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.07 
 
 		 695 aa  170  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 713 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  25.99 
 
 		 656 aa  163  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1406 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 697 aa  159  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.38 
 
 		 725 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  27.88 
 
 		 717 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  26.57 
 
 		 762 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.57 
 
 		 762 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  29.51 
 
 		 578 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 		 530 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  25.16 
 
 		 637 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  29.49 
 
 		 530 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  36.44 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  31.23 
 
 		 648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  30.99 
 
 		 542 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  29.33 
 
 		 525 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  26.63 
 
 		 720 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  30.51 
 
 		 322 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  28.19 
 
 		 527 aa  143  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  29.11 
 
 		 889 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  34.62 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  28.92 
 
 		 700 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  28.75 
 
 		 536 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  28.74 
 
 		 899 aa  137  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  25.97 
 
 		 532 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.65 
 
 		 594 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  35.29 
 
 		 624 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.49 
 
 		 549 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 685 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  30.04 
 
 		 614 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  30.43 
 
 		 742 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  23.54 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  31.49 
 
 		 670 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.99 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  25.62 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  23.83 
 
 		 484 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  24.53 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  23.93 
 
 		 636 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.24 
 
 		 625 aa  94.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  25.91 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 709 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  25.25 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  23.67 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  26.25 
 
 		 318 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 1037 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  22.65 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  25.45 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25.47 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  22.3 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  24.54 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  23.58 
 
 		 336 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2481  hypothetical protein  23.64 
 
 		 269 aa  54.3  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 808 aa  53.9  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  23.38 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  25.47 
 
 		 540 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 968 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 689 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  25.39 
 
 		 1415 aa  51.6  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  25.31 
 
 		 362 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 796 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  23.62 
 
 		 1470 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  23.62 
 
 		 1470 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19081  hypothetical protein  26.75 
 
 		 607 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0528969 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 		 761 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3395  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.96 
 
 		 652 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105857  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3538  hypothetical protein  24.39 
 
 		 250 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  23.08 
 
 		 281 aa  47.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.18 
 
 		 887 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  23.79 
 
 		 336 aa  47  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.24 
 
 		 676 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3181  hypothetical protein  23.64 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.394409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  30.83 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  29.14 
 
 		 336 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  24.82 
 
 		 917 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 748 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 566 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4252  sulfotransferase  34.82 
 
 		 286 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00749479  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  20.35 
 
 		 307 aa  43.9  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 255 aa  43.9  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>