11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3538 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3538  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  510  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3181  hypothetical protein  98 
 
 
250 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.394409  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1519  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0947507  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6258  hypothetical protein  34.89 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4074  hypothetical protein  34.89 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.488227  normal  0.187336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  30.72 
 
 
347 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  24.39 
 
 
524 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  26.27 
 
 
346 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  35 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  28.08 
 
 
341 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  25.52 
 
 
1209 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>