22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6258 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4074  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.488227  normal  0.187336 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6258  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3538  hypothetical protein  34.89 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3181  hypothetical protein  34.47 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.394409  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1519  hypothetical protein  26.84 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0947507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  35.09 
 
 
346 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1774  sulfotransferase domain-containing protein  30.21 
 
 
358 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  33.04 
 
 
347 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  30.97 
 
 
336 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  37.11 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4571  putative enzyme  30.91 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1941  hypothetical protein  30.32 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.944736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  28.97 
 
 
531 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
1991 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  29.31 
 
 
341 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1177  sulfotransferase  22.93 
 
 
325 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  37.25 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1933  sulfotransferase-like protein  38.89 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.345912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  28.09 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  28.97 
 
 
370 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  32.41 
 
 
725 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1252  hypothetical protein  29.2 
 
 
308 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>