213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2662 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  48.3 
 
 		 3322 aa  1140    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  100 
 
 		 2057 aa  3998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  34.31 
 
 		 1327 aa  275  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  34.31 
 
 		 1327 aa  273  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  33.99 
 
 		 1349 aa  270  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  29.25 
 
 		 1806 aa  260  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  32.16 
 
 		 1327 aa  243  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  31.27 
 
 		 4391 aa  240  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  32.32 
 
 		 1594 aa  239  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  30.09 
 
 		 2906 aa  236  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1165 aa  235  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1165 aa  235  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  31.27 
 
 		 4312 aa  234  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  32.19 
 
 		 1579 aa  231  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  29.16 
 
 		 1102 aa  228  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  33.27 
 
 		 466 aa  221  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.66 
 
 		 806 aa  221  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.38 
 
 		 868 aa  218  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  32.19 
 
 		 773 aa  205  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  36.14 
 
 		 989 aa  203  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  32.73 
 
 		 1234 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  32.13 
 
 		 1099 aa  175  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  32.21 
 
 		 1277 aa  172  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  32.53 
 
 		 950 aa  171  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  33.27 
 
 		 3506 aa  170  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  31.69 
 
 		 955 aa  167  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  32.64 
 
 		 1108 aa  167  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  30.38 
 
 		 1004 aa  165  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  31.56 
 
 		 955 aa  164  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  27.83 
 
 		 2711 aa  163  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  29.76 
 
 		 2637 aa  162  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  29.65 
 
 		 997 aa  160  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  30.17 
 
 		 995 aa  159  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.19 
 
 		 1086 aa  159  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1881 aa  157  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  32.35 
 
 		 1626 aa  155  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  31.62 
 
 		 1113 aa  148  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  30.72 
 
 		 818 aa  139  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1530 aa  138  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  30.19 
 
 		 1115 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 		 2926 aa  134  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  32.56 
 
 		 338 aa  133  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  30.23 
 
 		 825 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.37 
 
 		 1093 aa  133  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.37 
 
 		 1093 aa  133  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  29.69 
 
 		 1028 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  30.17 
 
 		 819 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  32.98 
 
 		 306 aa  130  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  31.1 
 
 		 1119 aa  129  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  26.65 
 
 		 3420 aa  127  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27.83 
 
 		 1741 aa  127  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  28.66 
 
 		 1234 aa  126  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.66 
 
 		 1234 aa  125  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  28.66 
 
 		 1250 aa  125  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  28.35 
 
 		 1234 aa  124  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  28.57 
 
 		 1254 aa  124  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  26.36 
 
 		 2578 aa  124  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  26.32 
 
 		 3415 aa  123  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  28.66 
 
 		 1252 aa  122  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.22 
 
 		 1055 aa  120  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.49 
 
 		 3629 aa  120  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  27.73 
 
 		 1250 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  29.64 
 
 		 1012 aa  119  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  29.83 
 
 		 1971 aa  116  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  31.49 
 
 		 861 aa  110  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  28.89 
 
 		 909 aa  111  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  27.62 
 
 		 1571 aa  109  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  29.92 
 
 		 1861 aa  108  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  30.58 
 
 		 1753 aa  108  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  29.97 
 
 		 1763 aa  108  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  29.25 
 
 		 1748 aa  104  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  30.48 
 
 		 2365 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.43 
 
 		 1532 aa  103  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  30.48 
 
 		 2346 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.9 
 
 		 1762 aa  103  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 		 1762 aa  103  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  34.63 
 
 		 1550 aa  103  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  28.96 
 
 		 2003 aa  100  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  27.35 
 
 		 1049 aa  99.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.39 
 
 		 1770 aa  98.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  29.13 
 
 		 1770 aa  98.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1882 aa  98.2  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  31.22 
 
 		 1508 aa  96.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 		 1458 aa  95.5  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.31 
 
 		 1023 aa  95.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.8 
 
 		 1067 aa  94.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.68 
 
 		 1322 aa  93.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  29.81 
 
 		 1459 aa  93.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  38.57 
 
 		 1593 aa  90.5  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  31.34 
 
 		 994 aa  90.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  31.1 
 
 		 2642 aa  87  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  26.56 
 
 		 4238 aa  86.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.02 
 
 		 3089 aa  84  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  45.65 
 
 		 1068 aa  84  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  47.57 
 
 		 995 aa  82.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.69 
 
 		 1848 aa  82.4  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  46.6 
 
 		 986 aa  81.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  27.49 
 
 		 947 aa  81.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.05 
 
 		 1357 aa  80.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  28.88 
 
 		 852 aa  77.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>