77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4391 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  904    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  88.99 
 
 		 455 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  69.34 
 
 		 468 aa  554  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  61.71 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  63.54 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  65.74 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  61.44 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  61.6 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  62.18 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  58.01 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  60.13 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  57.05 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  54.03 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  55.08 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  55.58 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.82 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  54.56 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  56.42 
 
 		 467 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  63.76 
 
 		 361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  54.78 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  56.93 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  54.3 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  54.35 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  55.48 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  54.89 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.25 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.19 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  50.41 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  57.76 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  54.12 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  53.4 
 
 		 457 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  46.97 
 
 		 505 aa  359  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  52.24 
 
 		 496 aa  356  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  52.08 
 
 		 476 aa  349  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.55 
 
 		 478 aa  346  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.56 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  53.12 
 
 		 448 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  55.24 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  52.14 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  55.11 
 
 		 441 aa  335  9e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  53.51 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  50.96 
 
 		 452 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  49.89 
 
 		 439 aa  328  9e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  53.88 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  55 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  50.62 
 
 		 473 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  39.17 
 
 		 509 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.68 
 
 		 523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.44 
 
 		 481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  39.51 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.44 
 
 		 532 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  36.93 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  41.05 
 
 		 501 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  35.28 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.78 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.98 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  33.45 
 
 		 673 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  40.53 
 
 		 840 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  44.35 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.91 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.1 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  26.08 
 
 		 572 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  38.54 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  33.81 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  32.67 
 
 		 2160 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.75 
 
 		 1755 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.74 
 
 		 1296 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.3 
 
 		 767 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.82 
 
 		 884 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  27.33 
 
 		 1332 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.2 
 
 		 530 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  32.26 
 
 		 863 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.71 
 
 		 575 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.52 
 
 		 852 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  34.91 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  26.71 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  32 
 
 		 527 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>