More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1733 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  100 
 
 
150 aa  303  6e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  66.67 
 
 
150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  64 
 
 
150 aa  200  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  47.22 
 
 
152 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  47.22 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  46.53 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  45.27 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  44.3 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  39.58 
 
 
145 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  42.47 
 
 
147 aa  117  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  40.71 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 
166 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 
166 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.14 
 
 
146 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.28 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
165 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
154 aa  93.6  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.54 
 
 
164 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.21 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.29 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  35.92 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.05 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  28.38 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.56 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.73 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  29.75 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  30.34 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.78 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  29.22 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.03 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.76 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.67 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.03 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.68 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  29.29 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.33 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.3 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.33 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0180  UspA domain protein  25.52 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.242763  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 
175 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  29.45 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.91 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.81 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  32.21 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.56 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  30.46 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  31.97 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.67 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  29.86 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.13 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  29.86 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  29.86 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  30.56 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  29.86 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.43 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  28.67 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  28.86 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  28.86 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.21 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  31.54 
 
 
297 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.19 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  27.89 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  31.76 
 
 
291 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.86 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  29.86 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.37 
 
 
294 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>