107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0037 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 830 aa  1563    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  56.88 
 
 		 1313 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  36.18 
 
 		 2296 aa  98.2  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  42.19 
 
 		 462 aa  96.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  39.61 
 
 		 1880 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  45.04 
 
 		 1632 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  45.04 
 
 		 1806 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  31.3 
 
 		 849 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.72 
 
 		 418 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  46.43 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  39.53 
 
 		 2796 aa  74.7  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  39.53 
 
 		 361 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  39.53 
 
 		 361 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  40 
 
 		 2342 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  40 
 
 		 2342 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.98 
 
 		 361 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 746 aa  69.3  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 857 aa  67.4  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1500  hypothetical protein  42.53 
 
 		 245 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  31.51 
 
 		 1134 aa  65.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 		 872 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  33.54 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  50.55 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  44.94 
 
 		 644 aa  62  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  41.38 
 
 		 143 aa  60.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  46.84 
 
 		 2178 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 1317 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 1075 aa  58.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  48.28 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1037 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2744  hypothetical protein  36.14 
 
 		 133 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  38.89 
 
 		 678 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3840  hemolysin-type calcium-binding region  36.67 
 
 		 1093 aa  55.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0668693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 1152 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 995 aa  54.3  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0461  surface layer protein SapB9  49.23 
 
 		 941 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0484  hypothetical protein  32.13 
 
 		 939 aa  53.5  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0960554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1726  hemolysin-type calcium-binding region  38.64 
 
 		 1144 aa  52.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.57086  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 1152 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  38.2 
 
 		 592 aa  52.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  35.56 
 
 		 294 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 1264 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  30.84 
 
 		 1971 aa  52  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  38.16 
 
 		 1895 aa  51.6  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  40.43 
 
 		 137 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1083 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  50.82 
 
 		 1699 aa  51.6  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  32.56 
 
 		 3259 aa  51.6  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  33.54 
 
 		 294 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  35.56 
 
 		 294 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  64.29 
 
 		 4798 aa  50.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  43.02 
 
 		 120 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  39.36 
 
 		 137 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  34.68 
 
 		 2567 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  29.41 
 
 		 4697 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  57.78 
 
 		 1424 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  52 
 
 		 2507 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 1247 aa  49.7  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40 
 
 		 1164 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  35.51 
 
 		 255 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  41.25 
 
 		 665 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  52 
 
 		 767 aa  49.7  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 3954 aa  48.9  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0481  surface array protein  49.12 
 
 		 921 aa  48.9  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  33.72 
 
 		 1805 aa  48.9  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  39.19 
 
 		 476 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 		 515 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2594  Hemolysin-type calcium-binding region  31.91 
 
 		 1099 aa  47.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  39.19 
 
 		 475 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  38.46 
 
 		 760 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  44.62 
 
 		 3608 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 756 aa  47.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  39.53 
 
 		 355 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.21 
 
 		 2668 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.56 
 
 		 3038 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  43.66 
 
 		 375 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  55.81 
 
 		 2775 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  38.78 
 
 		 942 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 1067 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  43.06 
 
 		 589 aa  46.2  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  48 
 
 		 727 aa  45.8  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  38.16 
 
 		 504 aa  45.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  47.06 
 
 		 1145 aa  45.8  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.77 
 
 		 1180 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  29.71 
 
 		 475 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  46.58 
 
 		 2950 aa  45.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  37.8 
 
 		 795 aa  45.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  38.3 
 
 		 2345 aa  45.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  40.79 
 
 		 221 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  42.11 
 
 		 950 aa  45.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  37.84 
 
 		 481 aa  45.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.19 
 
 		 421 aa  45.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  27.43 
 
 		 928 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  37.65 
 
 		 424 aa  44.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.35 
 
 		 1534 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.82 
 
 		 2911 aa  44.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  50 
 
 		 855 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  41.82 
 
 		 865 aa  44.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  35.38 
 
 		 932 aa  44.3  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>