17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1500 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  507  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  40.4 
 
 		 603 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  42.53 
 
 		 830 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  37.21 
 
 		 143 aa  62  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1313 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.91 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 2296 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2744  hypothetical protein  31.96 
 
 		 133 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 995 aa  52  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 		 1075 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  31.82 
 
 		 1805 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2603  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 824 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.780647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  31.63 
 
 		 1971 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 1239 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5062  hypothetical protein  51.28 
 
 		 107 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4601  hypothetical protein  52.63 
 
 		 107 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  0.053704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>