25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2744 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2744  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  35.85 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1313 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 2296 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  39.24 
 
 		 995 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  35.96 
 
 		 462 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  36.14 
 
 		 603 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 830 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  42.17 
 
 		 849 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1500  hypothetical protein  31.96 
 
 		 245 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  58.14 
 
 		 736 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  42.22 
 
 		 2796 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.55 
 
 		 418 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  45.35 
 
 		 2342 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  45.35 
 
 		 2342 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.1 
 
 		 1366 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  42.22 
 
 		 1806 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 665 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  44.07 
 
 		 1134 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  33.64 
 
 		 521 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  41.11 
 
 		 1632 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 857 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 746 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  38.27 
 
 		 592 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1075 aa  40  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>