More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2237 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
236 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  97.07 
 
 
239 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  92.17 
 
 
231 aa  451  1e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  85.25 
 
 
235 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  83.33 
 
 
236 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  62.08 
 
 
251 aa  321  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  62.08 
 
 
251 aa  321  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  67.3 
 
 
252 aa  318  4e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  67.3 
 
 
252 aa  318  4e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  67.3 
 
 
252 aa  318  4e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 
252 aa  317  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  66.35 
 
 
244 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 
239 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 
239 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 
239 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 
239 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 
239 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 
239 aa  315  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  66.35 
 
 
239 aa  311  8e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  66.35 
 
 
253 aa  310  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  67.77 
 
 
241 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  67.3 
 
 
241 aa  307  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  67.3 
 
 
238 aa  307  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
223 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
222 aa  183  2e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
220 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
219 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
237 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
247 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
217 aa  164  1e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 
220 aa  164  1e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
209 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
223 aa  147  2e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
245 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  39.02 
 
 
220 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
211 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  36.79 
 
 
220 aa  125  4e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  34.47 
 
 
205 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
215 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  34.84 
 
 
220 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
215 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 
215 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  9.36887e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
215 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
215 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
221 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
213 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
225 aa  121  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
205 aa  120  2e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
227 aa  120  2e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
221 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
221 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
215 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
221 aa  119  4e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
215 aa  119  4e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
215 aa  119  4e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
215 aa  119  5e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 
215 aa  117  2e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
215 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
242 aa  114  1e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
217 aa  114  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 
211 aa  114  1e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
211 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
215 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  1.33916e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
204 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
204 aa  112  4e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 
215 aa  112  4e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  31.88 
 
 
204 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  35.12 
 
 
214 aa  111  8e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  33.54 
 
 
211 aa  110  1e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
206 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
223 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
191 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
204 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
204 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
218 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
204 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
213 aa  88.6  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
220 aa  80.1  3e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  39.6 
 
 
221 aa  76.6  3e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
220 aa  74.3  1e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
227 aa  72  8e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 
206 aa  66.2  4e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
224 aa  65.1  1e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 
185 aa  57.8  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  5.3734e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 
230 aa  57  3e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 
217 aa  56.2  4e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
212 aa  55.8  5e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
191 aa  55.1  8e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 
231 aa  55.1  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
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NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
218 aa  55.1  1e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 
197 aa  54.3  2e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  39.66 
 
 
196 aa  53.5  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
212 aa  54.3  2e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
210 aa  53.5  3e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
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NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
222 aa  53.5  3e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
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NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
191 aa  53.1  3e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
195 aa  53.5  3e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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