More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2246 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  57.53 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 168 aa  157  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  50 
 
 		 168 aa  157  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  50 
 
 		 168 aa  157  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  50.32 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  46.85 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  47.92 
 
 		 172 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  48.65 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  48.23 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  52.67 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  46.81 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  42.18 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  42.18 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  42.18 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  42.18 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  42.18 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  42.18 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  42.47 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  41.78 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  40.67 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  45.26 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  43.07 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.22 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  43.07 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  41.22 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  41.22 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.01 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 		 215 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 208 aa  94.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  42.37 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 218 aa  90.9  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  40 
 
 		 217 aa  90.5  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.91 
 
 		 244 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 216 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  40 
 
 		 217 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  42.28 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.86 
 
 		 294 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 296 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.19 
 
 		 241 aa  87.4  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  40.35 
 
 		 481 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 		 228 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.46 
 
 		 248 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 206 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.02 
 
 		 237 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.59 
 
 		 240 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 242 aa  85.1  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  41.6 
 
 		 228 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.37 
 
 		 447 aa  85.1  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  43.52 
 
 		 294 aa  85.1  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  41.6 
 
 		 228 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  39.31 
 
 		 524 aa  84.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.99 
 
 		 212 aa  84.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 		 499 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  38.28 
 
 		 221 aa  84.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  42.27 
 
 		 328 aa  84.7  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 228 aa  84.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  39.42 
 
 		 656 aa  84.3  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  37.3 
 
 		 223 aa  84  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  48.28 
 
 		 623 aa  84  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  35.71 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  41.07 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  43.27 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.74 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.74 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.91 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  42.31 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  42.11 
 
 		 523 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  36.49 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 		 466 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 		 468 aa  82  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.14 
 
 		 607 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.81 
 
 		 367 aa  81.3  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  41.18 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.81 
 
 		 266 aa  81.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  36.51 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  36.29 
 
 		 319 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  39.06 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  40 
 
 		 219 aa  80.9  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>