More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1714 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  100 
 
 		 947 aa  1873    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  31.16 
 
 		 833 aa  293  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32 
 
 		 781 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.06 
 
 		 948 aa  277  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 936 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  32.02 
 
 		 977 aa  268  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28.51 
 
 		 834 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 828 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 828 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  28.69 
 
 		 920 aa  259  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  26.57 
 
 		 910 aa  258  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 931 aa  252  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.62 
 
 		 920 aa  251  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 830 aa  250  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 952 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  28.55 
 
 		 869 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  31.29 
 
 		 824 aa  243  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.61 
 
 		 827 aa  243  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  32.32 
 
 		 940 aa  241  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  30.24 
 
 		 828 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 1055 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 837 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 837 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  26.95 
 
 		 869 aa  232  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.23 
 
 		 912 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 837 aa  231  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  27.42 
 
 		 823 aa  230  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 915 aa  228  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  29.06 
 
 		 846 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 921 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 830 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  26.05 
 
 		 897 aa  223  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  28.53 
 
 		 919 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  27 
 
 		 800 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  30.96 
 
 		 753 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  28.12 
 
 		 812 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 779 aa  209  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  26.87 
 
 		 833 aa  208  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.8 
 
 		 877 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.89 
 
 		 877 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.8 
 
 		 800 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.64 
 
 		 875 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 791 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  36 
 
 		 922 aa  193  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.09 
 
 		 576 aa  189  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  31.89 
 
 		 919 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 852 aa  183  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 869 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 849 aa  170  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 803 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.1 
 
 		 568 aa  154  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.15 
 
 		 580 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 478 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  26.71 
 
 		 605 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  27.15 
 
 		 992 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  25.1 
 
 		 552 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  25.14 
 
 		 587 aa  115  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 565 aa  112  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  23.75 
 
 		 579 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  23.73 
 
 		 700 aa  107  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  23.22 
 
 		 700 aa  105  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23.39 
 
 		 552 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23.2 
 
 		 552 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  26.72 
 
 		 609 aa  102  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23.39 
 
 		 552 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  26.54 
 
 		 606 aa  99.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  33.18 
 
 		 557 aa  97.8  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.08 
 
 		 703 aa  97.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  35.57 
 
 		 425 aa  96.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  31.25 
 
 		 606 aa  96.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  26.89 
 
 		 992 aa  95.1  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  32.64 
 
 		 603 aa  94  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  30.36 
 
 		 558 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  30.36 
 
 		 558 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  30.36 
 
 		 558 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 473 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  26.12 
 
 		 573 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  29.15 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  30.51 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.22 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  25.65 
 
 		 283 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 268 aa  76.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  24.58 
 
 		 388 aa  73.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  28.45 
 
 		 264 aa  72.8  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  23.4 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  28.45 
 
 		 268 aa  72  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  24.62 
 
 		 379 aa  72  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  23.4 
 
 		 495 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 392 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  22.97 
 
 		 495 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 392 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  25.86 
 
 		 277 aa  70.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  24.32 
 
 		 270 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>