137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2624 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  100 
 
 		 573 aa  1136    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  23.9 
 
 		 478 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  24.14 
 
 		 936 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 824 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  22.31 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  26.12 
 
 		 947 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  23.9 
 
 		 846 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 940 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 823 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  22.46 
 
 		 952 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  22.33 
 
 		 830 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  25.53 
 
 		 812 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.77 
 
 		 827 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  21.55 
 
 		 1055 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 605 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  22.62 
 
 		 828 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  22.85 
 
 		 833 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  23.95 
 
 		 800 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  22.45 
 
 		 791 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 837 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  23.35 
 
 		 948 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.23 
 
 		 837 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  22.91 
 
 		 869 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  23.67 
 
 		 922 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  22.94 
 
 		 580 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  29.23 
 
 		 837 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  23.02 
 
 		 912 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  23.14 
 
 		 919 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  23.91 
 
 		 920 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  22.32 
 
 		 828 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  26.64 
 
 		 753 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  22.65 
 
 		 919 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  23.58 
 
 		 915 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  26.41 
 
 		 803 aa  65.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  22.71 
 
 		 910 aa  65.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  23.06 
 
 		 834 aa  65.1  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  23.82 
 
 		 869 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  23.44 
 
 		 931 aa  63.9  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  21.86 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  39.42 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  22.47 
 
 		 977 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.38 
 
 		 877 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  23.21 
 
 		 877 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  23.09 
 
 		 833 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  22.99 
 
 		 875 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  21.75 
 
 		 897 aa  60.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  22.83 
 
 		 779 aa  60.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  23.21 
 
 		 800 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  20.86 
 
 		 830 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.73 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  25.21 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  21.19 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  23.42 
 
 		 387 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 348 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 348 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 351 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  22.67 
 
 		 823 aa  55.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  21.51 
 
 		 379 aa  54.7  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 368 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  19.19 
 
 		 869 aa  53.5  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 368 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  23.18 
 
 		 992 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 368 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.24 
 
 		 473 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  25.1 
 
 		 264 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  19 
 
 		 365 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  24.14 
 
 		 270 aa  50.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  26.51 
 
 		 393 aa  50.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  20.58 
 
 		 920 aa  50.4  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.27 
 
 		 703 aa  50.4  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.38 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  17.18 
 
 		 852 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.24 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  24.7 
 
 		 387 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  24.14 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  24.23 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 992 aa  48.5  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  23.55 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>