61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1386 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  100 
 
 		 966 aa  1974    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3334  hypothetical protein  45.99 
 
 		 483 aa  363  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.920069  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  35.67 
 
 		 581 aa  290  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3223  hypothetical protein  35.94 
 
 		 462 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  0.039169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3103  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  35.16 
 
 		 763 aa  190  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3659  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  33.42 
 
 		 754 aa  188  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3275  leucyl-tRNA synthetase class Ia  29.13 
 
 		 892 aa  185  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0104078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3285  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 760 aa  164  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000203475  normal  0.48487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  33.89 
 
 		 768 aa  157  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2066  alginate lyase precursor  31.44 
 
 		 479 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0255  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  29.56 
 
 		 740 aa  145  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.651298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3640  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  28 
 
 		 756 aa  135  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0350459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3274  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  27.47 
 
 		 525 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000152835  hitchhiker  0.00641941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11518  putative alginate lyase precursor  29.1 
 
 		 771 aa  120  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0789  hypothetical protein  29.43 
 
 		 506 aa  114  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  33.14 
 
 		 554 aa  72  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  47.3 
 
 		 844 aa  72  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  29.68 
 
 		 1554 aa  71.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  39.02 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  48.05 
 
 		 990 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  38.27 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  35.54 
 
 		 679 aa  67.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  44.58 
 
 		 1270 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  45.12 
 
 		 931 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  35.34 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  39.45 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  44.05 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  40.23 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  36.05 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  44.93 
 
 		 562 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  36.36 
 
 		 695 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  41.18 
 
 		 468 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  42.7 
 
 		 689 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  38.82 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  35.42 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  42.7 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 851 aa  57.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  42.86 
 
 		 908 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  37.21 
 
 		 578 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  35.8 
 
 		 426 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  41.25 
 
 		 763 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  35.37 
 
 		 1302 aa  55.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  37.76 
 
 		 152 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1162 aa  54.7  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  37.5 
 
 		 829 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1106 aa  51.2  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  35.63 
 
 		 475 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  37.18 
 
 		 513 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  35.37 
 
 		 2324 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  38.03 
 
 		 748 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  31.46 
 
 		 520 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  36.25 
 
 		 545 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  42.86 
 
 		 492 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  22.77 
 
 		 446 aa  48.9  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  29.7 
 
 		 997 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  32.97 
 
 		 294 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  32.56 
 
 		 741 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  40 
 
 		 615 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  31.82 
 
 		 902 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  33.65 
 
 		 430 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.7 
 
 		 512 aa  45.8  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>