16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2066 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2066  alginate lyase precursor  100 
 
 		 479 aa  972    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3103  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  45.71 
 
 		 763 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3659  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  45.7 
 
 		 754 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3285  TonB-dependent receptor  45.21 
 
 		 760 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000203475  normal  0.48487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3640  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  42.06 
 
 		 756 aa  343  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0350459  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0255  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  42.6 
 
 		 740 aa  324  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.651298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  40.98 
 
 		 581 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11518  putative alginate lyase precursor  35.12 
 
 		 771 aa  271  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3275  leucyl-tRNA synthetase class Ia  35.96 
 
 		 892 aa  206  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0104078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  31.44 
 
 		 966 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3274  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  32.9 
 
 		 525 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000152835  hitchhiker  0.00641941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3334  hypothetical protein  35.16 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.920069  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0789  hypothetical protein  26.53 
 
 		 506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3223  hypothetical protein  28.36 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  0.039169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  39.44 
 
 		 768 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  24.27 
 
 		 1554 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>