18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0255 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0255  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  100 
 
 		 740 aa  1485    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.651298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3659  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  42.8 
 
 		 754 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3103  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  40.45 
 
 		 763 aa  515  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3285  TonB-dependent receptor  39.77 
 
 		 760 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000203475  normal  0.48487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3640  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  38.21 
 
 		 756 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0350459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2066  alginate lyase precursor  41.39 
 
 		 479 aa  323  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11518  putative alginate lyase precursor  30.86 
 
 		 771 aa  315  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  40.33 
 
 		 581 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3275  leucyl-tRNA synthetase class Ia  35.28 
 
 		 892 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0104078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  29.56 
 
 		 966 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3274  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  29.32 
 
 		 525 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000152835  hitchhiker  0.00641941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3334  hypothetical protein  31.85 
 
 		 483 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.920069  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3223  hypothetical protein  28.61 
 
 		 462 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  0.039169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0789  hypothetical protein  27.22 
 
 		 506 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  31.34 
 
 		 768 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  26.28 
 
 		 1554 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2544  hypothetical protein  22.99 
 
 		 465 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.103402  normal  0.0339199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  28.4 
 
 		 665 aa  44.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>