16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0789 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1054    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  25.1 
 
 		 581 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3285  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 760 aa  136  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000203475  normal  0.48487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3659  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  25.58 
 
 		 754 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3275  leucyl-tRNA synthetase class Ia  27.72 
 
 		 892 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0104078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2066  alginate lyase precursor  26.53 
 
 		 479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  29.43 
 
 		 966 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3640  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  26.88 
 
 		 756 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0350459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3103  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  27.6 
 
 		 763 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0255  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  27.08 
 
 		 740 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.651298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3274  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  26.48 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000152835  hitchhiker  0.00641941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11518  putative alginate lyase precursor  25.48 
 
 		 771 aa  82  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3334  hypothetical protein  25.83 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.920069  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3223  hypothetical protein  23.29 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  0.039169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  24.04 
 
 		 768 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  23.74 
 
 		 1554 aa  47.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>