More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0871 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  100 
 
 		 500 aa  987    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  91.42 
 
 		 501 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  46.72 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  46.72 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  45.24 
 
 		 491 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  43.31 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  43.5 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  47.05 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  47.73 
 
 		 504 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  48.7 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  42.97 
 
 		 527 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.32 
 
 		 483 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  42.61 
 
 		 527 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.32 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.94 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  41.12 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  43.42 
 
 		 524 aa  357  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.8 
 
 		 487 aa  353  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  46.19 
 
 		 509 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  43.15 
 
 		 527 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  44.4 
 
 		 523 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  42.46 
 
 		 508 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  41.6 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  41.27 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  46.41 
 
 		 501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  47.38 
 
 		 496 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.86 
 
 		 501 aa  342  9e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  43.49 
 
 		 516 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  43.6 
 
 		 528 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  46.44 
 
 		 503 aa  339  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  46.44 
 
 		 503 aa  339  8e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  46.52 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  43.72 
 
 		 511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  44.71 
 
 		 493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  44.71 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  46.52 
 
 		 496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  41.72 
 
 		 508 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  44.1 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.25 
 
 		 476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  43.97 
 
 		 493 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.32 
 
 		 535 aa  335  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  38.66 
 
 		 529 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  45.8 
 
 		 498 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  45.09 
 
 		 513 aa  332  7.000000000000001e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  43.25 
 
 		 525 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  44.56 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  47.68 
 
 		 524 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.45 
 
 		 476 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  42.08 
 
 		 523 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  45.92 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.46 
 
 		 515 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  43.11 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.83 
 
 		 500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  44.16 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  41.25 
 
 		 505 aa  326  7e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.21 
 
 		 524 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  42.98 
 
 		 501 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  42.4 
 
 		 520 aa  325  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  40.42 
 
 		 537 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.21 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  41.88 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  41 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.76 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  44.3 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.89 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  41.76 
 
 		 528 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  43.3 
 
 		 492 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  44 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  43.3 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  39.47 
 
 		 506 aa  323  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.79 
 
 		 501 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.76 
 
 		 511 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  39.3 
 
 		 523 aa  323  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  43.57 
 
 		 516 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.19 
 
 		 522 aa  322  8e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  38.48 
 
 		 578 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  43.3 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  42.22 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  44.27 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.46 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  46.33 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  44.05 
 
 		 474 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.18 
 
 		 457 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  42.7 
 
 		 485 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.85 
 
 		 497 aa  319  9e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.76 
 
 		 588 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.33 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.9 
 
 		 502 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.9 
 
 		 502 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.9 
 
 		 502 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  41.87 
 
 		 499 aa  316  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  43.78 
 
 		 478 aa  316  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.46 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  46.31 
 
 		 498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  42.06 
 
 		 502 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  42.06 
 
 		 502 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  44.03 
 
 		 479 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  42.06 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  45.8 
 
 		 499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  42.06 
 
 		 461 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>