146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6213 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 444 aa  887    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  49.62 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  35.65 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  41.39 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  43.7 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  41.53 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  39.22 
 
 		 363 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  39.22 
 
 		 363 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  37.93 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  29.69 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  33.96 
 
 		 391 aa  136  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  31.44 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  33.47 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  38.42 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  37.93 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  32.49 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  36.71 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  25.48 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  30.3 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  36.23 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  29.52 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  29.52 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  33.49 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  30.18 
 
 		 373 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  32.13 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  30.95 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  36.95 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  32.32 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  33.82 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  30.43 
 
 		 380 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  33.97 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  30.12 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  26.62 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  32.87 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  32.69 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  25.68 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  28.72 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  28.96 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  35 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0020  conjugation TrbI-like protein  32.74 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  26.72 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  31.73 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  33.72 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  32.37 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  29.76 
 
 		 396 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  29.05 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  28.44 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  34.08 
 
 		 423 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  31.75 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  34.48 
 
 		 402 aa  96.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  33.46 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  30.43 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  32.32 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  30.43 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  33.82 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  31.4 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  33.94 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  34.95 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  30.43 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  30.29 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  31.63 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  31.16 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  31.88 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  36.41 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  34.2 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  30.46 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  30.46 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  30.99 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  37.93 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  33.59 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  32.46 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  31.1 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  33 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  33.21 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  30.14 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  30.68 
 
 		 425 aa  93.6  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  31.16 
 
 		 407 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  31.16 
 
 		 407 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  29.55 
 
 		 380 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  33.85 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  33.5 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  46 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  29.95 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  29.47 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  34.5 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  31.37 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  33.59 
 
 		 423 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  31.91 
 
 		 402 aa  90.5  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  33.08 
 
 		 423 aa  90.5  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  34.38 
 
 		 190 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  34.09 
 
 		 427 aa  89.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  33 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  35.47 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  33.58 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  32 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  33 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  33 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  30.91 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  35.5 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  26.43 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>