More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0710 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2442  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.43 
 
 		 259 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000823282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.43 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00538028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1602  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.58 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4394  serine protease  41.8 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.76 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0097  serine protease  43.63 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2551  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.75 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.73 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.750805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1502  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.85 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1208  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.54 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.47 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  28.1 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.23 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  32.2 
 
 		 503 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  30.48 
 
 		 494 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.42 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  30.48 
 
 		 494 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  30.53 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1819  hypothetical protein  31.63 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1664  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  31.63 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.442424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.53 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  30.48 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  31.71 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1641  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  31.63 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  29.9 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.15 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  30 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.78 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.78 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  30 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.78 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  30 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  29.9 
 
 		 495 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.81 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1430  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  31.63 
 
 		 546 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.94162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  29.9 
 
 		 495 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  29.9 
 
 		 495 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  30.61 
 
 		 489 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  31.19 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0449  MucD  31.63 
 
 		 546 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  29.9 
 
 		 495 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  29.9 
 
 		 483 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  29.9 
 
 		 483 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  29.9 
 
 		 483 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.28 
 
 		 584 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  29.85 
 
 		 478 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  29.65 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  29.52 
 
 		 494 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2658  protease signal peptide protein  30.61 
 
 		 502 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  29.47 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  30.54 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  30.1 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  29.95 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1333  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.35 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  27.23 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  26.92 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  30.1 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  29.52 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  30.1 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  27.11 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  29.52 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  27.86 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  27.63 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  29.95 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  26.83 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  30.48 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  29.05 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  28.57 
 
 		 489 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  26.25 
 
 		 459 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  25.83 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  29.59 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  31.31 
 
 		 411 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  25.73 
 
 		 503 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  26.98 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  26.7 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  29.08 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  29.59 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  28.44 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  28.32 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.69 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  29.08 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  28.93 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  27.91 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  30.46 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.8 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.07 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  29.77 
 
 		 523 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  28.16 
 
 		 518 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  25.24 
 
 		 503 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.98 
 
 		 392 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  27.1 
 
 		 498 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.52 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  28.57 
 
 		 472 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  27.93 
 
 		 528 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.86 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  29.8 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>