201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2185 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  98.6 
 
 		 214 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  81.09 
 
 		 214 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  44.49 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  45.37 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  44.05 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  38.71 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  43.11 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  44.05 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  49.04 
 
 		 161 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  34.3 
 
 		 358 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  35.78 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  43.29 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  34.82 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  35.81 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  42.38 
 
 		 167 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  41.83 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  45.1 
 
 		 172 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  45.7 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  32.52 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  32.14 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  44.81 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  34.39 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  41.36 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  38.96 
 
 		 195 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  45.8 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  40.82 
 
 		 534 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  39.23 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  44.65 
 
 		 163 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  45.74 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  39.23 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  36.9 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  39.86 
 
 		 176 aa  92  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  45.52 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  37.82 
 
 		 166 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  30.74 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  36 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  44.03 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  33.47 
 
 		 388 aa  85.9  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  43.24 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  33.76 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  31.84 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  33.33 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  33.2 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  36.97 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  37.01 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  37.01 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  32.74 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.9 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  32.88 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.19 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.26 
 
 		 175 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  34.16 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  40.71 
 
 		 185 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  34.78 
 
 		 153 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  37.67 
 
 		 177 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.38 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  41.73 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  30.91 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  28.57 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  35.62 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.1 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.34 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.94 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.52 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.69 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.7 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  28.71 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  39.02 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.39 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.82 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.48 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  42.5 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  26.35 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  32.82 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.89 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  31.75 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  41 
 
 		 158 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  30.95 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  33.77 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  29.25 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  36.89 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  36.23 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  34.78 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  31.3 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.97 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.8 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  51.85 
 
 		 352 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  29.08 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  36.08 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  36.08 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.94 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  36.72 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  35.19 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  30.3 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.61 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  35.67 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  31.85 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>