More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3040 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  54.45 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  49.6 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  46.05 
 
 		 371 aa  348  8e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  47.67 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  47.67 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  47.98 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  47.04 
 
 		 370 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  42.58 
 
 		 371 aa  333  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  46.58 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  43.77 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  45.01 
 
 		 370 aa  317  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  44.08 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  41.33 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  44.12 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  40.27 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  39.89 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  39.52 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  42.2 
 
 		 376 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  39.62 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  37.26 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  39.89 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.08 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  38.08 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  38.08 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  38.08 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  38.08 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  38.08 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  38.08 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  38.08 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  40.44 
 
 		 371 aa  279  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  37.91 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  38.11 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  38.11 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  38.11 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  38.11 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  38.01 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  38.11 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  39.18 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 		 365 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 		 376 aa  272  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  38.13 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  38.13 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  36.62 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  38.9 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 378 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  38.2 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  39.3 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  37.43 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  42.2 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  37.43 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  37.77 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  37 
 
 		 373 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 		 372 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  35.03 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  35.85 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  36.39 
 
 		 377 aa  245  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  36.63 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  38.5 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  35.37 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  36.34 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  39.37 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  38.44 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  35.51 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  35.33 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  35.92 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  36.03 
 
 		 377 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  34.15 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  34.76 
 
 		 376 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  34.05 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  36.95 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  35.98 
 
 		 377 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  33.51 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  32.26 
 
 		 382 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  30.96 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  31.81 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  33.24 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  34.15 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 		 427 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.24 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  33.96 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>