131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2657 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
202 aa  405  1e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
180 aa  74.3  1e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 
210 aa  72.8  3e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  33.58 
 
 
182 aa  68.9  5e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
182 aa  68.2  8e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  34.96 
 
 
208 aa  67.4  1e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 
185 aa  67.4  1e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
179 aa  66.6  2e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
209 aa  67  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
202 aa  64.3  1e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
192 aa  63.2  3e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.20531e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
188 aa  62.8  3e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
211 aa  62.8  4e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  27.66 
 
 
198 aa  59.3  4e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
187 aa  58.5  7e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  30.86 
 
 
202 aa  57.8  1e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
224 aa  56.6  2e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
207 aa  57  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
238 aa  56.2  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
238 aa  56.2  3e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  35.64 
 
 
238 aa  56.2  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
238 aa  56.2  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  35.64 
 
 
238 aa  56.2  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  35.64 
 
 
238 aa  56.2  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
192 aa  55.5  5e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  40 
 
 
207 aa  55.5  6e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
199 aa  54.7  9e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
194 aa  54.7  1e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
187 aa  54.3  1e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
214 aa  53.9  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
184 aa  53.1  2e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 
188 aa  53.9  2e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
211 aa  52.8  4e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
199 aa  52.8  4e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
211 aa  52.8  4e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
211 aa  52.8  4e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
197 aa  51.6  7e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
177 aa  52  7e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  27.35 
 
 
215 aa  51.2  1e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  27.62 
 
 
205 aa  50.8  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.84066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
188 aa  50.1  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
187 aa  49.3  4e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
186 aa  49.3  4e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
193 aa  48.9  5e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
215 aa  48.5  6e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
205 aa  48.1  8e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
206 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
202 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
204 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  30.47 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
305 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  25.19 
 
 
189 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
215 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  33.85 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 
245 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  31.36 
 
 
203 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
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