More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2945 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  96.03 
 
 		 378 aa  731    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 378 aa  759    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  81.22 
 
 		 368 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  78.04 
 
 		 368 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  78.04 
 
 		 368 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  74.87 
 
 		 368 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  75.6 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  75.6 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  75.07 
 
 		 368 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  74.8 
 
 		 368 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  75.6 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  75.6 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  75.6 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  75.6 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  75.07 
 
 		 368 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  75.6 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  75.07 
 
 		 368 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  75.6 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  75.07 
 
 		 368 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  75.33 
 
 		 368 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  74.07 
 
 		 366 aa  578  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  74.07 
 
 		 374 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  44.65 
 
 		 370 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  44.92 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  46.26 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  41.98 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  44.3 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  42.25 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  41.6 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  41.71 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  38.73 
 
 		 369 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  38.73 
 
 		 369 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  42.05 
 
 		 372 aa  292  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  41.78 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  42.32 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  40.63 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  37.33 
 
 		 368 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  39.79 
 
 		 368 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  41.02 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  38.13 
 
 		 369 aa  272  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  39.36 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 370 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  38.2 
 
 		 365 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  38.99 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  38.46 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 		 370 aa  242  7.999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 		 371 aa  242  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  34.66 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  36.08 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  34.96 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  33.6 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  35.83 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.25 
 
 		 376 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  32.01 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  31.83 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 		 375 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.8 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  31.58 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  35.26 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  32.81 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  29.97 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  29.18 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  33.05 
 
 		 369 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  29.87 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.16 
 
 		 381 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  27.25 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  26.88 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 		 376 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 387 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  27.93 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.8 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  31.05 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>