More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2049 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  81.56 
 
 		 179 aa  315  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 179 aa  276  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 179 aa  276  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  271  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  269  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 179 aa  258  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  52.97 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  190  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  50.81 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  48.65 
 
 		 184 aa  185  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  48.59 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 180 aa  180  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  50 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  48.89 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  46.93 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  47.37 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  43.89 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  48.59 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  45.25 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  45.95 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  47.31 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  45 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  44.13 
 
 		 178 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  47.93 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  47.65 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  47.95 
 
 		 182 aa  170  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  48.9 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  45.2 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  44.69 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  47.37 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  43.48 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  45.2 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  43.48 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  45.2 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>