123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82713 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  100 
 
 
250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  61.87 
 
 
278 aa  353  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  55.97 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  56.22 
 
 
235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  52.46 
 
 
236 aa  246  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  37.4 
 
 
247 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  41.39 
 
 
271 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  41.74 
 
 
253 aa  168  7e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  39.81 
 
 
238 aa  166  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  37.45 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  42.66 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  42.2 
 
 
259 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  42.2 
 
 
259 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  41.47 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.65 
 
 
241 aa  159  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.28 
 
 
249 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  39.37 
 
 
271 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  37.96 
 
 
289 aa  158  8e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  37.4 
 
 
240 aa  156  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  34.55 
 
 
249 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  36.59 
 
 
242 aa  153  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  35.83 
 
 
243 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.39 
 
 
251 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  36.82 
 
 
241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  35.56 
 
 
239 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  39.34 
 
 
258 aa  151  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  35.98 
 
 
240 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  34.15 
 
 
240 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  36.18 
 
 
251 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  33.74 
 
 
241 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  35.66 
 
 
248 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.21 
 
 
256 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  37.79 
 
 
264 aa  148  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  37.74 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  37.61 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  34.15 
 
 
263 aa  146  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  39.25 
 
 
231 aa  146  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.32 
 
 
243 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  35.68 
 
 
245 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  37.26 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  36.17 
 
 
285 aa  139  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  36.63 
 
 
250 aa  136  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  36.07 
 
 
245 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  35.85 
 
 
272 aa  135  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  34.55 
 
 
237 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  39.13 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  31.84 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  38.3 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  34.09 
 
 
257 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  34.86 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  38.62 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  34.33 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  39.77 
 
 
245 aa  125  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  38.46 
 
 
299 aa  125  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  33.94 
 
 
246 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  37.33 
 
 
299 aa  123  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  34.72 
 
 
298 aa  121  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  28.92 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  33.47 
 
 
280 aa  118  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  30.68 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  36.22 
 
 
246 aa  115  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  33.48 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  34.56 
 
 
269 aa  111  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  32.8 
 
 
238 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  24.9 
 
 
245 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  34.7 
 
 
236 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  32.26 
 
 
259 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  28.92 
 
 
247 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  34.46 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  29.21 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  31.05 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.52 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.17 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  32.47 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  28.65 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  27.75 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  30 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  32.29 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.95 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  31.25 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  26.6 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  30.65 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.49 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  31.25 
 
 
201 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.2 
 
 
203 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.89 
 
 
203 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  30.05 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  25.26 
 
 
201 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  30.21 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  26.29 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  31.31 
 
 
211 aa  58.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  29.32 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  26.29 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  27.42 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.11 
 
 
196 aa  55.8  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  28.87 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  26.84 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.16 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>