153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40092 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  100 
 
 		 456 aa  932    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  34.44 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  31.46 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.39 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  26.4 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  28.36 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  24.71 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  26.91 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  26.91 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  26.98 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  26.52 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  28.85 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31781  predicted protein  25.9 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  28.7 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  23.06 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  29.72 
 
 		 275 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  28.57 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  23.79 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  26.12 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  27.36 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  30.32 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  25.58 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  26.27 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  28.04 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  29.8 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  24.46 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  26.89 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  26.51 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  25.68 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  24.37 
 
 		 221 aa  57  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  25.31 
 
 		 324 aa  57  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  27.97 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  26.79 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  27.53 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  23.21 
 
 		 216 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  24.22 
 
 		 215 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  24.22 
 
 		 215 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0033  hypothetical protein  26.38 
 
 		 230 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  27.49 
 
 		 235 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  34.18 
 
 		 541 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  27.06 
 
 		 325 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  22.46 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  23.26 
 
 		 343 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  26.19 
 
 		 322 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  39.74 
 
 		 250 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  25 
 
 		 329 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  22.81 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  24.23 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 		 366 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  41.94 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  30.28 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  39.34 
 
 		 213 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  36.71 
 
 		 235 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  24.88 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  35.21 
 
 		 227 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  38.33 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  28.06 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  26.45 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  22.69 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  36.59 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  43.48 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  22.27 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  40.62 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  26.07 
 
 		 658 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  32.95 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  38.71 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  37.33 
 
 		 482 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  32.94 
 
 		 355 aa  47.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  36.62 
 
 		 494 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  35.29 
 
 		 356 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  24.11 
 
 		 323 aa  47  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  38.27 
 
 		 496 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  36.62 
 
 		 224 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  40 
 
 		 466 aa  46.6  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  29.66 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  31.03 
 
 		 227 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  38.1 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  31.58 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  33.72 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  31.51 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  39.29 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  38.46 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  25.9 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  33.85 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  32.26 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3291  RecA-superfamily implicated in signal transduction ATPase-like protein  32.61 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0345006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  29.46 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  38.1 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  23.84 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  29.17 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  34.52 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  32.31 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  29.46 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  26.77 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1028  DnaB domain protein helicase domain protein  29.63 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  30.53 
 
 		 339 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  31.4 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  32.43 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>