139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1023 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  100 
 
 
315 aa  626  1e-178  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  44.76 
 
 
330 aa  239  5e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  44.13 
 
 
332 aa  235  7e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  42.72 
 
 
358 aa  235  9e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  43.81 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  42.22 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  40.85 
 
 
358 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  43.49 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  39.38 
 
 
324 aa  219  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  42.22 
 
 
312 aa  215  7e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  41.46 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  37.5 
 
 
324 aa  211  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  39.49 
 
 
311 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  39.62 
 
 
350 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  40.78 
 
 
307 aa  203  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  39.13 
 
 
348 aa  198  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  37.19 
 
 
325 aa  195  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  36.61 
 
 
388 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  36.53 
 
 
343 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  37.99 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  38.1 
 
 
324 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  36.86 
 
 
323 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  36.91 
 
 
325 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  36.31 
 
 
325 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  36.99 
 
 
407 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  36.76 
 
 
329 aa  178  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  35.48 
 
 
658 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  36.88 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  36.88 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  36.25 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  34.88 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  34.98 
 
 
322 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  35.94 
 
 
322 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  36.01 
 
 
365 aa  169  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  32.74 
 
 
348 aa  169  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  32.64 
 
 
343 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  32.28 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  34.39 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  33.43 
 
 
349 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  38.36 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  31.07 
 
 
343 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  40.77 
 
 
250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  33.93 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  28.97 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  30.57 
 
 
243 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  27.43 
 
 
363 aa  95.9  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  30.9 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  31.44 
 
 
221 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  29.49 
 
 
227 aa  86.3  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  39.41 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  32.03 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  32.07 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  30.1 
 
 
554 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  29.11 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  27.4 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  41.35 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  27.03 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  27.48 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  26.13 
 
 
215 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  28.45 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.74 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  31.17 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  27.23 
 
 
213 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  28.87 
 
 
235 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  30.32 
 
 
456 aa  59.3  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  26.64 
 
 
235 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  26.86 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  27.98 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  25.6 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  24.88 
 
 
598 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  28.72 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  28.85 
 
 
356 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  32.53 
 
 
463 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  24.68 
 
 
541 aa  53.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  28.28 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  28.64 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  27.46 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  25.88 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  27.88 
 
 
450 aa  49.3  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  26.34 
 
 
347 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  27.14 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  27.4 
 
 
361 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  25.36 
 
 
343 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  27.27 
 
 
455 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  28.37 
 
 
360 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  29.25 
 
 
356 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  31.03 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  26.11 
 
 
353 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  26.07 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  23.32 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  25.12 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  25.82 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  25.58 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  27.27 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  28.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  27.49 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  28.84 
 
 
365 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  26.53 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  25.98 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  27.88 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>