More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1658 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1658  recA protein  100 
 
 
377 aa  749    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  57.54 
 
 
379 aa  385  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  57.59 
 
 
347 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  57.45 
 
 
364 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  57.94 
 
 
365 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  57.41 
 
 
344 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  56.17 
 
 
346 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  56.48 
 
 
345 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  57.14 
 
 
345 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  55.86 
 
 
343 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  57.63 
 
 
418 aa  375  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  56.97 
 
 
345 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  57.14 
 
 
345 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  55.59 
 
 
368 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  56.97 
 
 
341 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  53.82 
 
 
352 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  55.72 
 
 
345 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  56.07 
 
 
376 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  53.01 
 
 
347 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  54.05 
 
 
364 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  56.07 
 
 
350 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  55.14 
 
 
357 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  56.39 
 
 
359 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  53.01 
 
 
347 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  56.39 
 
 
345 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  58.79 
 
 
355 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  52.91 
 
 
351 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  57.06 
 
 
347 aa  375  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  55.76 
 
 
347 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  56.17 
 
 
375 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  55.45 
 
 
347 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  54.28 
 
 
351 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  55.21 
 
 
350 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  56.66 
 
 
349 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0296  recA protein  56.67 
 
 
339 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  55.84 
 
 
365 aa  368  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  54.94 
 
 
366 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  55.08 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  57.23 
 
 
352 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  54.57 
 
 
348 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  58.04 
 
 
347 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  55.08 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  55.78 
 
 
346 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  54.8 
 
 
350 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  55.08 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  54.91 
 
 
350 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  55.38 
 
 
347 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  54.49 
 
 
348 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  53.24 
 
 
350 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  55.76 
 
 
352 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  51.59 
 
 
347 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2973  recA protein  52.79 
 
 
375 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.480691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  53.89 
 
 
367 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  54.73 
 
 
383 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  59.29 
 
 
344 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  54.24 
 
 
359 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  54.49 
 
 
348 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  55.1 
 
 
337 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  52.46 
 
 
350 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  53.66 
 
 
336 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  54.21 
 
 
364 aa  363  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  56.92 
 
 
356 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  55.73 
 
 
346 aa  363  3e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  54.85 
 
 
342 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  57.19 
 
 
345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  54.22 
 
 
378 aa  362  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  57.06 
 
 
356 aa  362  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  51.58 
 
 
349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  57.28 
 
 
346 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  57.33 
 
 
348 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  54.95 
 
 
347 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  54.04 
 
 
361 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  51.21 
 
 
335 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  54.35 
 
 
348 aa  360  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  56.29 
 
 
360 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0938  recombinase A  56.57 
 
 
356 aa  360  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  56.57 
 
 
356 aa  359  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  54.41 
 
 
343 aa  360  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  54.41 
 
 
343 aa  360  3e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  54.4 
 
 
347 aa  359  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  54.8 
 
 
364 aa  358  6e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  54.97 
 
 
364 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  52.2 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  54.13 
 
 
349 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  54.66 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  54.83 
 
 
355 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  52.68 
 
 
340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  54.74 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  55.28 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  54.74 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  54.46 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  52.42 
 
 
362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  54.12 
 
 
355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  56.05 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  54.91 
 
 
414 aa  355  5e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  54.06 
 
 
347 aa  355  5e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  54.29 
 
 
379 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  55.31 
 
 
357 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  53.78 
 
 
349 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  53.78 
 
 
349 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>