More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3994 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3994  recA protein  100 
 
 		 352 aa  702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  83.97 
 
 		 347 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  82.08 
 
 		 350 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  83.09 
 
 		 347 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  82.51 
 
 		 347 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  82.51 
 
 		 347 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  82.51 
 
 		 347 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  82.61 
 
 		 345 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  85.07 
 
 		 359 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  81.21 
 
 		 350 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  81.69 
 
 		 346 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  83.23 
 
 		 365 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  81.16 
 
 		 345 aa  577  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  81.69 
 
 		 345 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  81.27 
 
 		 350 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  82.46 
 
 		 350 aa  578  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  82.93 
 
 		 366 aa  574  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  85.2 
 
 		 376 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  79.77 
 
 		 347 aa  569  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  82.04 
 
 		 378 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  79.43 
 
 		 350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  79.19 
 
 		 345 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  82.03 
 
 		 348 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  79.02 
 
 		 348 aa  554  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  82.82 
 
 		 364 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  78.74 
 
 		 348 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  77.68 
 
 		 349 aa  551  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  77.01 
 
 		 367 aa  545  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  79.29 
 
 		 351 aa  547  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  77.26 
 
 		 351 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  79.28 
 
 		 352 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  80.24 
 
 		 368 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  78.25 
 
 		 383 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  77.49 
 
 		 344 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  73.8 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  72.89 
 
 		 379 aa  509  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  72 
 
 		 346 aa  498  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  70.77 
 
 		 350 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  72.39 
 
 		 363 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  68.71 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  67.96 
 
 		 364 aa  484  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  72.09 
 
 		 362 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  68.6 
 
 		 390 aa  484  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  67.58 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  71.6 
 
 		 342 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  71.65 
 
 		 379 aa  482  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  68.18 
 
 		 341 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  67.69 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  70.68 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  67.69 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  70.25 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  65.87 
 
 		 341 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  70.72 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  66.97 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  72.32 
 
 		 354 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  70.5 
 
 		 336 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  68.15 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  70.68 
 
 		 343 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  71.88 
 
 		 345 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  70.43 
 
 		 346 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  71.88 
 
 		 345 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  68.39 
 
 		 358 aa  475  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  70.68 
 
 		 343 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  68.31 
 
 		 343 aa  474  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  69.88 
 
 		 358 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  68.71 
 
 		 362 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  67.9 
 
 		 348 aa  471  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  67.9 
 
 		 348 aa  472  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  68.4 
 
 		 364 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  67.36 
 
 		 343 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  70.09 
 
 		 343 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  68.73 
 
 		 355 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  69.02 
 
 		 360 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  68.31 
 
 		 355 aa  472  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  72.31 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  68.73 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  68.73 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  66.87 
 
 		 424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  68.73 
 
 		 347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  67.48 
 
 		 361 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  69.66 
 
 		 353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  67.17 
 
 		 362 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  67.68 
 
 		 361 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  69.66 
 
 		 353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  70.31 
 
 		 356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  69.14 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  68.39 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  67.48 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  68.73 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  68.73 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  67.99 
 
 		 360 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  69.66 
 
 		 353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  69.66 
 
 		 353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  69.66 
 
 		 353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  68.11 
 
 		 347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  68.52 
 
 		 357 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  66.57 
 
 		 358 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  70.43 
 
 		 358 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.87 
 
 		 363 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  67.17 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>